Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LGMNQ99538 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms