Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VAT1Q99536 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms