Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3AQ96ST3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms