Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC22A12Q96S37 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC22A12Q96S37 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms