Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SHDQ96IW2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms