Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC126Q96EE4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC126Q96EE4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms