Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C18orf8Q96DM3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms