Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRT35Q92764 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms