Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CSRNP3Q8WYN3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CSRNP3Q8WYN3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms