Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
GIPC3Q8TF64 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms