Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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MCOLN3Q8TDD5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MCOLN3Q8TDD5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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