Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEDD1Q8NHV4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEDD1Q8NHV4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms