Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
C17orf47Q8NEP4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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C17orf47Q8NEP4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C17orf47Q8NEP4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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C17orf47Q8NEP4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C17orf47Q8NEP4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C17orf47Q8NEP4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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C17orf47Q8NEP4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C17orf47Q8NEP4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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