Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC112Q8NEF3 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms