Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
GCSAMQ8N6F7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms