Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB11FIP4Q86YS3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB11FIP4Q86YS3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB11FIP4Q86YS3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB11FIP4Q86YS3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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RAB11FIP4Q86YS3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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RAB11FIP4Q86YS3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB11FIP4Q86YS3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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