Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC6BQ86SZ2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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