Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ANKRD54Q6NXT1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms