Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ANKRD40Q6AI12 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms