Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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LINC01545Q5VT33 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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