Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LGSNQ5TDP6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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