Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SFT2D3Q587I9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms