Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms