Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DDR2Q16832 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DDR2Q16832 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms