Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPROQ16827 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPROQ16827 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPROQ16827 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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PTPROQ16827 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PTPROQ16827 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PTPROQ16827 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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