Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA3Q16787 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA3Q16787 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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