Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ZNF239Q16600 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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