Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FXNQ16595 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FXNQ16595 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FXNQ16595 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FXNQ16595 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FXNQ16595 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FXNQ16595 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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