Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SGCBQ16585 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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