Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC18A3Q16572 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms