Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPE65Q16518 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RPE65Q16518 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPE65Q16518 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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