Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ATP6AP1Q15904 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms