Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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