Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFKBIBQ15653 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms