Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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