Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARHGEF6Q15052 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms