Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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