Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL19A1Q14993 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL19A1Q14993 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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COL19A1Q14993 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COL19A1Q14993 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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