Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SLC10A1Q14973 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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