Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ERV3-1Q14264 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ERV3-1Q14264 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms