Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KCNC3Q14003 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNC3Q14003 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms