Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms