Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CUL1Q13616 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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