Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
EIF4EBP1Q13541 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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