Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C1orf61Q13536 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C1orf61Q13536 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms