Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FOXE3Q13461 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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