Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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AP3B2Q13367 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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AP3B2Q13367 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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AP3B2Q13367 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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AP3B2Q13367 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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AP3B2Q13367 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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