Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRSF5Q13243 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRSF5Q13243 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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