Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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RPA4Q13156 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPA4Q13156 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RPA4Q13156 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RPA4Q13156 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RPA4Q13156 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RPA4Q13156 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RPA4Q13156 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RPA4Q13156 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RPA4Q13156 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RPA4Q13156 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPA4Q13156 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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