Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRAF1Q13077 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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